Bohemya alanında kutsal Roma imparatorluğu döneminde, IV.Karl (Charles) tarafından 1348 yılında kurulmuştur. Çok sayıda ünlü bilim adamının ve yazarın mezun bulunduğu önemli okullardan biridir. Nikola Tesla, Franz Kafka bunlardan bazılarıdır.

1707 yılında kurulan Çek Teknik Üniversitesi, Avrupa’nın en köklü ve saygın teknik üniversitelerinden biridir. Prag’da yer alan üniversite, mühendislik ve teknoloji alanında güçlü akademik geleneği, araştırma odaklı yapısı ve modern eğitim altyapısıyla öne çıkmaktadır.

Uluslararası öğrencilere açık yapısı, İngilizce program seçenekleri ve Avrupa genelinde tanınan diploması sayesinde, Avrupa’da kaliteli ve prestijli bir üniversite eğitimi hedefleyen öğrenciler için güvenilir bir tercihtir.

Çek Yaşam Bilimleri Üniversitesi (Česká zemědělská univerzita v Praze) 1906 yılında kurulmuştur. Çek Cumhuriyetinde en büyük ve en çok öğrencisi olan Üniversitelerin arasındadır. 18 000 oğrencisi vardır (10% yabancı öğrencidir). Eğitim dili İnglizce olan birçok bölümü vardır.

Masaryk Üniversitesi, Brno şehrinde bulunmaktadır. 1919 yılında kurulan üniversite, 200’den fazla bölüme sahiptir. Enstitü ve klinikleriyle birlikte toplam 9 fakültesi bulunmaktadır.

Olomouc Palacky üniversitesi, Prag Charles üniversitesi’nden sonra ülkenin en eski ikinci üniversitesidir. Kuruluşu 1573 yılına kadar dayanıyor.